Το Αρχαιολογικό Μουσείο Σύρου στεγάζεται στο Δημαρχείο της Ερμούπολης, με ανεξάρτητη είσοδο από τη δυτική πλευρά. Πυρήνας του Μουσείου ήταν η αρχαιολογική συλλογή, από επιγραφές κυρίως, που συγκέντρωσε ο Ιωάννης Κοκκώνης το 1834.